違いが良く判らないので調べてみました。
私なりに解釈できた内容
Skype au：普通の携帯電話のような回線交換方式(一部パケット使っている)
Skype for Android：パケット通信方式(3G / Wi-Fi)方式
Skype auの○と×：
○待ち受け状態にしていても消費電力をおさえる事が出来る
○通話品質が通常の電話と同様で着信も同等
×国内専用
×試験期間終了後、有料化の可能性あり
Skype for Androidの○と×：
○Skype for PCと同様にパケットのみ
○Wi-Fi環境のみで利用可
○Skype同士は無料
×常に接続確認の通信が必要な為、待ち受けだと電力消費が激しい、常に待ち受けで使うには電源を繋いで置かないとダメ
×3G環境で利用するにはパケ放題加入が必要
パケ放題が嫌いな私には
Wi-Fi環境＆常時電源確保できれば「Skype for Android」ですね。
国内、海外関係無く使えるし・・・・
気軽に何処でも常時携帯しながらSkypeを使いたいならSkype auって事ですね。
多少利用が制限されても良ければSkype for Androidなのかな？
参考
http://internet.watch.impress.co.jp/docs/column/shimizu/20101207_412253.html
※今使っている携帯の事をガラケー（ガラパゴス携帯の略）と呼ぶんですね（苦笑）